Olá.
Sou especialista em Linux há 18 anos atuando com o sistema.
Notei que você tem necessidade de interação a recursos gráficos por algum motivo. Você não precisa que o servidor gráfico esteja rodando para acessar aplicações locais. Isso pode ser feito através de um tunnel ssh, de forma que você sequer precisa ter o programa instalado localmente para tal acesso. COm isso, você reduzirá drasticamente a necessidade de reboot no servidor, reduzirá consumo de memória, risco de vunerabilidade por quaisquer fragilizades no servidor gráfico etc.
O sistema operacional escalona as tarefas automaticamente para os núcleos disponíveis, mas você pode otimizar a prioridade do processo, tunning no I/O do disco e manipulação do cache em disco feito pela swap.
Qual base de dados é utilizada? A base está realmente otimizada?
Uma das coisas que se pode fazer para tunar adequadamente o I/O é ter a base em uma partição separada e desabilitar algumas flags do sistema de arquivos para reduzir a escrita no inodes. Além disso, manipular o READAHEAD do disco ajudará a empurrar adequadamente os dados sem gerar gargalos.
Já trabalhei com AWS e sei que o custo é alto, inclusive tráfego de dados. Utilizar o RDP para o Linux não é a melhor das opções.
Minha proposta é trabalhar esses pontos indicados e a performance tem que ser avaliada posteriormente por você para ver se algo precisa ser tunado de forma diferente.
Considere também um período de instabilidade por conta dos ajustes e, se a demanda for grande, melhorar a performance pode causar inicialmente um gargalo. Mas todos esses detalhes posso prever mediamente antes de iniciar o processo.
Acredito em 6 horas de trabalho como tempo suficiente, mas se as tarefas que eu especificar passarem disso (por conta dos cuidados), não cobrarei a mais.
Sugiro um valor de R$ 400,00 pelo serviço.
Vou descrever as etapas como 1 dia cada, mas divida isso dentro das horas citadas, assim como o preço total sendo o valor de 400,00.
Pra finalizar, o acesso dar-se-á por ssh, que é um tunel criptografado e que consumirá menos recursos do sistema e de banda. AInda, preciso saber o quê exatamente você visualiza nesse servidor Linux.